Meskipun letaknya berdekatan, SMA Negeri Chidori dan Akademi Swasta Kikyo khusus perempuan seolah berada di dua dunia yang berbeda. Akademi Kikyo dikenal memiliki reputasi yang sempurna dan mayoritas siswanya berasal dari keluarga kaya, sementara Chidori dipenuhi oleh murid-murid nakal yang dianggap bodoh. Seluruh siswa Kikyo menyimpan kebencian mendalam terhadap tetangga mereka dari Chidori.
Rintarou Tsumugi, seorang siswa Chidori berusia enam belas tahun, sering dijauhi orang karena wajahnya yang terlihat menyeramkan. Namun, Rintarou tidak terlalu mempedulikannya, karena ia sudah merasa cukup dengan teman-teman dekatnya. Meski begitu, ada satu hal yang belum ia ceritakan kepada mereka: sesekali, ia membantu di toko kue milik keluarganya.
Suatu hari saat bekerja, Rintarou melihat seorang pelanggan duduk di meja, namun gadis itu pergi sebelum ia sempat berbicara dengannya. Keesokan harinya, ia menerima permintaan maaf dari gadis tersebut, Kaoruko Waguri, yang menjelaskan bahwa ia bukan kabur karena penampilan Rintarou, dan justru percaya bahwa Rintarou adalah orang yang baik hati. Meski Rintarou belum terbiasa dengan kepribadian cerah Kaoruko, ia mulai menantikan persahabatan dengan gadis itu. Sayangnya, ada satu rintangan besar yang menghadang: Kaoruko adalah siswa Kikyo!
