Bisnis berjalan lambat untuk Agen Detektif Ootsuji. Soutarou dan sahabat karibnya yang masih remaja, Saki, akan mengambil pekerjaan apa pun yang datang, bahkan yang terdengar lebih berisiko daripada yang sepadan. Saat itu adalah musim festival di kota, namun jauh dari perhatian publik, sebuah gelombang penghilangan misterius telah terjadi. Seorang wartawan koran menyewa Soutarou untuk menyelidikinya, dan berpendapat bahwa jawabannya mungkin ada di suatu tempat di Dark, labirin anarkis yang terkenal kejam yang merupakan fisik, sosial, dan moral di bawah tanah kota itu. Soutarou mensubkontrakkan pekerjaan tersebut kepada Saki, tetapi segera menyesal ketika anak itu juga hilang. Sekarang Soutarou harus menjelajah sendiri ke dalam kegelapan, dan menghadapi para penghuni bawah tanah yang meragukan, termasuk geng Topeng Tertawa yang jahat dan regu polisi pemberontak yang mengemudikan kereta api lapis baja Demon 463 yang menakutkan!
