The 100 Years Quest: sebuah misi yang begitu menantang dan berbahaya yang belum terselesaikan selama lebih dari satu abad. Meskipun banyak penyihir yang telah mencoba untuk melakukan misi yang melelahkan ini, hasilnya berakhir dengan kekalahan besar atau lebih buruk lagi. Meskipun demikian, Natsu Dragneel dan teman-temannya-Lucy Heartfilia, Gray Fullbuster, Erza Scarlet, dan Wendy Marvell, bersama dengan Happy dan Charlés-yang memiliki kemampuan lebih- dengan penuh semangat memulai pencarian tersebut.
Setahun setelah guild Fairy Tail berhasil mengalahkan kekuatan jahat Acnologia dan Zeref, Natsu dan timnya melakukan perjalanan ke benua utara Guiltina, di mana mereka mencari pemilik Quest 100 Tahun dan menerima misi yang nyaris mustahil: menyegel Lima Dewa Naga-sekelompok orang dengan kekuatan yang sangat besar, yang jika dibiarkan, dapat menyebabkan kehancuran global. Sementara itu, seorang anggota baru yang penuh semangat bernama Touka direkrut ke Fairy Tail. Meskipun energinya yang penuh semangat dan sifatnya yang penuh gairah membuatnya sempurna untuk serikat, tampaknya ada lebih banyak hal yang ada dalam dirinya daripada yang terlihat.
Bertekad untuk menyelesaikan misi mereka yang tampaknya tidak dapat diatasi, Natsu dan teman-temannya memulai pencarian berbahaya mereka untuk Dewa Naga. Namun, begitu bertemu dengan guild gelap baru bernama Diabolos, bersama dengan anggota terbaru Fairy Tail yang menunjukkan sifat aslinya, Natsu dan timnya akan menemukan bahwa Quest 100 Tahun bukanlah satu-satunya tantangan yang mereka hadapi.
